Aluevaaleissa valituilla valtuutetuilla on edessään vaativa työrupeama. Ensimmäiseksi aluevaltuusto asettaa aluehallituksen ja hyvinvointialueen muut toimielimet sekä valitsee hyvinvointialuejohtajan. Ensimmäisten päätösten listalla on myös hyvinvointialuestrategiasta, hyvinvointialueen hallintosäännöstä sekä hyvinvointialueen talousarviosta ja taloussuunnitelmasta päättäminen. Hallintosäännön toivotaan vahvistuvan jo valtuuston ensimmäisessä kokouksessa. Hallintosäännössä määritellään hyvinvointialueen käynnistämisvaiheen johtamisjärjestelmä, toimielimet sekä tehtävien ja toimivallan jako eri toimielinten välillä.